Als „Chimäre“ werden von uns Oligonukleotide bezeichnet, die aus unterschiedlichen Bausteinkombinationen wie z.B. DNA und RNA oder Rückgratmodifikationen wie Thioat/Phosphat bestehen.

Die Bestellung chimärer Oligonukleotide gestaltet sich etwas komplizierter als bisher beschrieben wurde. Nachdem Sie aus dem „Typ“-Menü „Chimäre“ ausgewählt haben, wird Ihre Oligonukleotidsequenz pro Base über drei Buchstaben definiert:

Der erste Buchstabe (d, r, q und o) steht entweder für:

I. Desoxyribonukleotid; „d“
II. Ribonukleotid; „r“
III. 2’Amino-Ribonukleotid; „q“
IV. 2’Methoxy-Ribonukleotid; „o“

Mit der zweiten Bezeichnung können Sie wie gewohnt Ihre Base auswählen.

Die dritte Position kennzeichnet die Verknüpfung zweier Bausteine (p und s). Dabei können Sie zwischen einer Phosphat („p“) oder einer Thiophosphat („s“) Modifikation auswählen:

I. Phosphat; „p“
II. Thioat; „s“

Sie müssen also im Chimären-Modus immer drei Buchstaben auswählen, um eine Position in Ihrer Sequenz definieren zu können. Selbstverständlich haben Sie auch hier die Möglichkeit, über die Hilfefunktion an weitere nützliche Informationen zur Eingabe Ihrer Sequenz zu kommen. Bitte beachten Sie, dass am 3’ Ende Ihrer Sequenz die letzte Base nur über die ersten beiden Buchstaben definiert ist. Modifikationen können Sie in diesem Modus nur an die Enden Ihrer Sequenz einfügen. Verwenden Sie hierbei bitte die Schreibweise:

I. 5’ Modifikation; Phosphat „XXp“ bzw. Thioat „XXs“
II. 3’Modifikation; „XX“

 

Die Bestellung von RNAi Oligonukleotiden verläuft zur Vereinfachung über einen gesonderten Bestellmodus. In diesem Modus gibt es eine Unterteilung zwischen dem RNA- und dem DNA-Teil eines RNAi Moleküls. Der RNA-Teil besteht aus 19-25 RNA Einzelbausteinen (a,c,g und u) und liegt am 5’-Ende des RNAi Moleküls. Die DNA-Sequenz ist hingegen aus 0-4 Einzelbausteinen (a,c,g und t) aufgebaut, die sich am 3’-Ende der RNA-Sequenz befinden. Einträge in das DNA Fenster werden dadurch automatisch ans 3’-Ende der RNA-Sequenz addiert. Beim Ablegen der fertigen Sequenz erscheinen diese Abschnitte im Warenkorb mit dem Kürzel „d“ (z.B. dt). Gesonderte Modifikationen sind erlaubt und können über ein X zugeordnet werden.

An dieser Stelle möchten wir uns für das Vertrauen, dass Sie unseren Produkten entgegenbringen, bedanken.

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